《金篆玉函》作為一部傳說中由黃帝時代流傳下來的玄學典籍，其秘密主要圍繞以下核心內容展開：

1. 五術體系
   書中構建了以陰陽五行為基礎的“山、醫、相、命、卜”五術體系，涵蓋修身養性、疾病治療、命運推演、風水相術及占卜預測。其中“山”術最為深奧，包含《玄典》《養生》《修密》三部分，涉及道家經典、氣功修煉及符咒武術等12。

2. 歷史傳承
   傳說該書歷經姜太公、鬼谷子、張良、諸葛亮等歷史人物之手，內容隨時代演變逐漸分化為不同流派。例如諸葛亮得道術，郭璞得堪輿術，至明代劉伯溫助朱元璋建立明朝后隱退2。

3. 散佚與爭議
   經過四千年傳承，《金篆玉函》內容多有增刪，現存版本多為后世整理。其部分內容如靈療、符咒等被現代視為“迷信”，但五術理論仍被視作東方科學的重要遺產12。